引起晚上睡觉后脑勺疼的原因比较多，一般分为生理性原因和病理性原因。
生理性的原因：由于夜间睡眠姿势不良引起头皮与颈部肌肉的紧张收缩，产生肌收缩性疼痛，或局部肌肉紧张，牵拉颈神经引起颈神经疼痛，导致后脑勺疼痛。比如睡眠时喜欢枕高枕头，容易对颈部、脑部的神经造成一定的刺激，从而引起头痛现象的出现。这种情况可以通过更换枕头来缓解。
病理性的原因：有颈椎病史，因刺激交感神经，可引起血压高升成为颈性高血压，这也可能是引起头痛并影响睡眠的原因之一。高血压性头痛，高血压时因脑血管发生痉挛也可引起头痛，但多为全头痛，以后脑勺疼痛者不多见，且夜间血压多低于白天。病理性的原因若对生活没有太大的影响不需要治疗，有颈椎病史的平时注意生活习惯，还可以通过牵引按摩的方式来改善。高血压性头疼的注意按时服用降压药。