生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒，一型或者二型引起的皮肤黏膜的一些病变，而梅毒是由梅毒螺旋体造成了一个全身性的、系统性的感染，两者区别还是非常大的。单纯疱疹病毒只是在黏膜表面，引起一些局部的水疱，很少会引起全身的反应，有些生殖器疱疹的患者会有一些发热或者全身不适的症状，但是有这些症状的患者是非常少的。
但是梅毒就不一样了，梅毒它比较隐匿，它会在全身各个部位，都会引起一些症状，包括骨骼，包括我们的眼睛，包括我们的神经系统，包括我们的心血管系统，它都有可能会侵犯。单纯疱疹病毒造成的生殖器疱疹，是经常会反复发作的，梅毒我们是可以治愈的，但是梅毒的抗体在我们的体内是终身存在的，梅毒分为三期，一般我们在一期或二期做一些积极的驱梅的治疗，我们就可以把这个疾病阻断，也可以把这个疾病完全治疗，生殖器疱疹我们有治疗的药物，但是现在还没有完全阻止它复发的药物。