安宫牛黄丸里面含有多种寒凉药物，一般来说，在饭后半小时、饭前2小时服用比较好，可以防止损伤胃气。中风是安宫牛黄丸治疗的主要疾病之一，对脑血管痉挛、脑出血、脑梗死引起的多种中风都有明显的疗效。服用的最佳时间是在中风先兆出现时，当发生口齿不清、视物模糊、口眼歪斜、手足麻木无力时就要服用，不要等病人出现了昏迷再用。如果错过最佳时机，已经发生脑出血或脑梗死，建议在发病24小时内服用，越早吃效果越好。
临床研究证实，安宫牛黄丸具有保护脑细胞、减轻脑细胞损伤及损伤后脑水肿、改善脑循环、促进脑细胞功能恢复的功效。因此，对于颅脑损伤出现意识障碍，肝硬化及肝癌晚期出现的肝性脑病昏迷，肺气肿、肺癌晚期引起的肺性脑病昏迷，都应尽快使用，以免脑细胞出现不可逆的损伤。安宫牛黄丸具有良好的退热作用，还可治疗重症肺炎、病毒性痢疾、败血症、非典、甲流等各种病因引起的持续性高热。当出现高热不退时，也应尽快使用，避免持续高热引起的脑损害，导致病情恶化。北京同仁堂安宫牛黄丸选用天然牛黄、天然麝香，虽然价格稍高，但是功效更为可靠。