范可尼综合征在临床表现上多种多样，大多数成年以后出现症状，患者会有尿糖以及多种氨基酸尿，另外会有低磷血症，近端肾小管性酸中毒，低尿酸血症，肾小管性蛋白尿，低钾血症，表现为：肌无力、软瘫、周期性的瘫痪。
低钙血症会出现抽搐，长期的低钙有可能会引起继发性甲状旁腺功能亢进，肾性骨病，该病最突出的一种表现是小孩儿维生素d缺乏以及成人的骨软化症。
继发性范可尼综合征的临床表现基本上与原发性的一样，一般情况下根据临床类型主要是分为原发性范可尼综合征，患者主要表现为氨基酸尿、葡萄糖尿以及出现低钾血症的表现，另外小孩儿有可能表现为脱水、便秘、无力、发热、生长发育迟缓。
还有一些继发性的范可尼综合征，患者主要是表现为维生素d缺乏以及侏儒症，还有可能表现为甲状腺功能低下，糖尿病、脾大、脑水肿，儿童有可能会出现肾脏病变，眼睛病变。